Budějovice a Chrudim neobdržely licenci spolu s dalšími druholigovými kluby Příbramí a Ústím nad Labem už v květnu v první fázi řízení. Proti rozhodnutí licenční komise se všechny čtyři kluby odvolaly, uspěly jen Příbram s Ústím. Dynamo řeší problémy se stadionem, aktuálně mu od města běží výpovědní lhůta ze smlouvy na užívání Střeleckého ostrova. Právě kvůli tomu zřejmě neobdrželo potřebnou licenci pro druhou ligu.
V následujícím ročníku třetí ligy by mohla nastat paradoxní situace, kdy by soutěž hrála dvě mužstva z Budějovic. V polovině května náměstek primátorky Petr Maroš (Naše Česko) ČTK řekl, že by město rádo přihlásilo do třetí ligy tým, přičemž licenci by získalo od některého současného účastníka České fotbalové ligy (ČFL).
Web isport.cz ve středu informoval, že nový klub je dohodnutý na licenci s Brozany. Kvůli možným změnám ve druhé lize však hrozí, že by jejich aktuální třetí místo od konce ve skupině B ČFL mohlo znamenat sestup.
Možná je i varianta, že se majitelka Dynama Dorothy Nneka Edeová s městem dohodne a klub mu prodá. V takovém případě by Dynamo pokračovalo pod stávající značkou ve třetí lize. Jihočeši přitom v minulé sezoně opustili nejvyšší soutěž, za dva roky tak spadli o dvě úrovně.
Chrudim je včetně jejího předsedy Tomáše Linharta a čtyř hráčů aktuálně vyšetřována v kauze s ovlivňováním výsledků. Východočeský klub loni bojoval o první ligu, v baráži s Pardubicemi jen těsně neuspěl.
Na místo administrativně vyřazených klubů se o patro výš posouvají Kladno s Českou Lípou. Oba týmy vyhrály v ČFL své skupiny a příští týden se měly spolu utkat v baráži o postup do druhé ligy. Vzájemné dvojutkání se však za těchto okolností hrát nemusí. Středočeský celek hrál druhou ligu naposledy v ročníku 2010/11, Česká Lípa se do ní vrací dokonce po 27 letech.
Situace zahrála do karet i Jihlavě, která se v uplynulé druholigové sezoně spolu s poslední Spartou B nedokázala sportovní cestou zachránit. Nyní se však Vysočiny druhá nejvyšší soutěž znovu bude týkat a na podzim v ní začne devátou sezonu v řadě.